服用短期避孕药有一些禁忌症和甚用的情况，比如对于一些严重的心血管疾病、血栓性的疾病，在服用短效避孕药后由于雌孕激素的刺激，有可能会增加、增重原有的心血管疾病和血栓性的疾病。此外，对于部分恶性肿瘤以及哺乳期妇女还是建议要尽量避免这些短效避孕药的使用。对于这些短效的避孕药有一些妇女可能会出现副作用，比如类早孕的反应，在服药初期，大约有10%的妇女会出现食欲缺乏、恶心、呕吐、乏力、头晕等类似孕早期的早孕反应，一般不需要特殊处理，坚持服药几个周期之后，副作用自然就会消失。
但是，对于症状非常严重的妇女，可能需要考虑更换制剂或者停药改用其他的避孕措施，还有一些妇女在服用了这些短效避孕药之后，会出现不规则的阴道出血，服药期间阴道出血又称为突破性出血，大多数都会发生在漏服避孕药之后，有少数没有漏服避孕药也会发生，轻者点滴出血不需要处理，随着用药的延长，而逐渐的减少直到停止，对于那些流血偏多的病人，每晚在服用避孕药的同时，可能还需要额外加服雌激素，一直到停药。还有一些大约是1%-2%的妇女可能会发生闭经，尤其是对于原来月经就不规则的妇女，在使用这些短孕的避孕药之后，还是建议要谨慎，而且一旦停孕之后月经没有来潮，需要进行除外妊娠以及由于早期研制的避孕药中，雄激素的活性比较强，因此会对一些妇女服药之后产生体重以及皮肤方面的变化，也有极少数的妇女会在服用了短效避孕药之后出现头痛、复视、乳房胀痛等不适，只需要进行对症处理，大多数都是不需要进行停药的。
