妇科支原体感染最常用的药有阿奇霉素、红霉素、氧氟沙星、盐酸左氧氟沙星、盐酸多西环素等，都可以用于治疗支原体感染，主要是口服、静脉用药。对于支原体感染选用什么药，最理想的方法是根据药物敏感试验，取宫颈分泌物做支原体培养，同时做药物敏感试验，根据药敏试验的结果选取最敏感的药物。支原体感染的治疗周期需要半个月，治疗半个月以后需要再次复查是否还有支原体培养阳性。
患者复查以后，支原体培养阴性，可以不需要继续治疗，这就是治疗成功。女性支原体感染有很多是内源性感染，女性的阴道内有极少数存在支原体，一般情况不会导致致病。在某些因素下支原体大量繁殖，有可能会引起支原体感染，支原体感染大多是隐性感染，最初的临床症状可能会引起轻度的尿频、尿急，主要是侵犯泌尿生殖道黏膜引起宫颈管炎，最终可能会导致宫内膜炎，甚至输卵管炎症，对于支原体感染应该积极治疗。