尿道有针扎样疼痛，常见以下几种原因：
1、非病理因素：如果是偶然性的疼痛感，绝大多数与尿液浓缩、长期憋尿、饮水过少等因素有关，适当多饮水、及时排尿即可改善。
2、病理性因素：如果是持续的疼痛，可能有尿道炎、男性前列腺炎、尿道结石等疾病，需要进一步检查才能确诊。尿道炎患者可以出现尿道针扎样疼痛，并伴有尿频、尿急、尿道分泌物增多等症状，需要进行尿液化验检查进一步确诊。尿道结石可以造成尿道堵塞，结石刺激可引起针扎样疼痛感，伴有排尿不畅或者尿道口滴血的表现。男性前列腺炎可以出现疼痛，伴有尿频、尿急、会阴区胀痛和不适，部分患者还可以伴有失眠、焦虑等症状，需要进一步进行前列腺液化验检查确诊。