眼球上有小黑点具体是看在什么部位上，首先可能是异物入目，黑色颗粒状的异物进入到结膜囊内，嵌顿在眼球表面上。如果是在黑眼球上出现的小黑点，有可能是后方虹膜上的色素痣。
白眼球上出现小黑点最常见，一般情况是巩膜蓝白。尤其是在儿童阶段，巩膜比较清透，薄厚不均匀，可以透见下方脉络膜而表现为局部暗色斑点。也可能是巩膜静脉血管穿过巩膜组织时迂曲，同时伴有少许的色素沉着。也可能是巩膜上有色素沉着，或者其他各种理化因素刺激巩膜黑变，但是此病的发病率比较低。