任何头部的疼痛首先都要除外继发性头疼，继发性头疼可能是全身性疾病，也可以是脑局部的疾病，比如发烧会引起头疼、高血压会引起头疼，这是全身性疾病。
另外，头部的器质性疾病也会引起。脑炎、脑膜炎、蛛网膜下腔出血、脑出血、脑血管病、头部外伤、硬膜下血肿、癌症。
还有炎性脱髓鞘性疾病，可能也都是引发头疼的原因，包括静脉窦的血栓形成，这些都得一一排除，还有脑颅内的肿瘤也要除外。
另外，如果把上述系统性疾病都排除之后，就考虑是原发性或者特发性头疼，这种可能是偏头疼、丛集性头疼或紧张性头疼等。