在怀孕两个月上厕所出现有褐色分泌物，有以下几种情况：第一、可能是由于女性本身有便秘，在上厕所时由于腹压增加过大，本身早孕期胚胎着床不稳固，容易会出现少部分蜕膜剥脱就会有褐色分泌物，要注意是否有先兆流产。第二、当患有阴道炎、宫颈炎症时，由于阴道内的细菌感染会导致阴道壁黏膜的破裂，会出现有褐色分泌物。当出现褐色分泌物时要去医院做妇科查体、妇科B超和抽血化验HCG、孕酮的水平，如果胚胎发育良好没有异常，在饮食上注意多吃含粗纤维的食物。适当的吃新鲜的蔬菜、水果，保持大便通畅，是有阴道和宫颈的炎症，积极的给予相应的处理，以免影响胎儿的发育。