胃镜能够检查食管、胃、十二指肠球部以及降部，对于在这些部位发生的病变，都有很好的检测作用。对于食管而言，主要可以帮助查出有无反流性食管炎、食管癌。对于胃部病变，比如说胃息肉、胃癌或者是萎缩性胃炎、糜烂性胃炎以及浅表性胃炎，胃镜都能帮助明确诊断。
对于十二指肠球，可以见到常见的有十二指肠球溃疡。对于十二指肠降部、十二指肠乳头开口的异常，比如十二指肠乳头占位、十二指肠乳头癌，胃镜也能初步的诊断。由此可见，从食管、胃、十二指肠球部、十二指肠降部这些占位性病变，以及溃疡性病变，胃镜都能帮助进行鉴别诊断。