孕妇吃了小龙虾畸形的原因有以下几种：一、因为个人的体质情况所造成的，小龙虾是较少使用的食物，部分个体可能对小龙虾所含的营养物质过敏或者对孕妇产生毒性反应，可能引起孕妇吃小龙虾后导致胎儿畸形，是比较少见的，仅见于极个别的异常体质。二、可能是小龙虾含有毒素，也就是在烹饪加工小龙虾过程中，因为加工处理不当或者小龙虾的身体中的某个部位没有被去除掉，导致制作过程中形成毒素。毒素或者小龙虾体内的异常物质被孕妇吃到体内，在体内经过代谢分解被胎儿间接吸收导致胎儿发育畸形，也是很常见的原因。