黄连素是从黄连、黄柏等植物中提炼出来的一种有效成分，学名为盐酸小檗碱，属于化学药物是一种西药。黄连素是治疗腹泻的常用药物，但并不是所有类型的腹泻都能够治疗。
黄连素抗菌谱广泛对于许多种细菌具有抑制作用，只适用于由痢疾杆菌、大肠杆菌等引起的轻型细菌性感染性腹泻，对于非感染性的腹泻没有效果反而会导致肠道菌群失调，使腹泻加重，感染性腹泻需要明确其致病菌，对于合并严重并发症的重症腹泻需要联合其他抗生素进行补液治疗。