手足口病的疹子，一般情况下不会化脓，除非继发了细菌感染，有可能会出现化脓的情况，但这种几率相对来说不高。手足口病的疹子，多数情况下病程相对不是很长，而且疹子一般不会有明显的瘙痒，所以用手去搔抓皮疹的几率应该不是很高。但对于婴幼儿来说，也要注意防止用手去搔抓这些皮疹，如果反复用手搔抓皮疹，不除外有继发感染的可能，尤其对于已经破损的皮疹，如果用不干净的手去搔抓，这种情况就会存在细菌感染的可能。一旦发现继发细菌感染，局部皮疹出现红肿，甚至化脓，应该及时到医院就诊，采取抗感染的药物来治疗。
手足口病是病毒感染引起的一些皮疹，本身是一种自限性疾病，也缺乏特效的抗病毒药物治疗，通常都是采用对症的处理。一般多喝水、保证休息，对于皮疹来说，如果局部有破损，可以考虑应用龙胆紫局部涂抹。如果继发细菌感染，可以外用抗菌药物的软膏，也可以口服抗菌药物来治疗。