神经内分泌瘤的治疗手段包括手术治疗、放疗、化疗，以及靶向药物治疗为主，手术治疗主要是治疗神经内分泌瘤的主要的治疗方式，包括外科切除手术，以及内镜下的微创手术治疗。药物治疗则包括神经内分泌瘤的化学治疗、靶向药物治疗，以及生物治疗等。神经内分泌瘤的一般性治疗还包括保证人体内环境的稳定，例如维持水电解质平衡、纠正酸碱平衡紊乱等，这些是治疗神经内分泌瘤的前提，并且功能性神经内分泌瘤，常会分泌各种影响代谢的激素，常会导致内分泌的紊乱，调整内环境非常重要。
神经内分泌瘤的药物治疗，包括生长因素抑素类似物的治疗，以及干扰素的治疗、靶向药物的治疗，而手术治疗是治疗神经内分泌肿瘤最主要的治疗方法，如未合并严重并发症或者转移，原则上都应进行彻底的手术切除，以及淋巴清扫手术。