绝大多数肩关节腔积液可自行消除，如果疾病较难控制，治疗并不到位，积液可能会存在较长时间。
肩关节腔积液在绝大多数情况下，见于肩关节炎症导致的滑膜增生，分泌大量积液，通过休息、用消炎和消肿药控制炎症，绝大多数积液能自己吸收。还有一种情况是肩关节有器质性损伤，如肌腱撕裂或骨损伤等其他外伤，导致肩关节积液，甚至血肿，这种情况下可能会吸收较慢。这样的疾病如果不从根本上解决，积液可能会消除更慢。患者可进行局部物理治疗，如微波理疗或远红外线理疗，同时可遵医嘱口服中药，如盘龙七片、大七厘胶囊，对局部积液吸收也有一定的作用。
肩关节腔积液患者要进行关节制动，能够减少积液形成。如果是由于肩周炎而导致的肩关节腔积液，患者需及早进行治疗，在治疗期间要锻炼肩关节，同时可遵医嘱用消炎止痛药减轻症状。