植物神经失调通过调整植物神经的药物，首先可以用一些抑郁症的药物，包括多虑平，可以用一种新型的抑郁症的药物，如5-羟色胺再摄取抑制剂，通过舍曲林、氟西汀、帕罗西汀等等，可以改善大部分因为植物神经紊乱引起的症状，包括睡眠障碍或者情绪波动等等。
通过药物效果欠佳，还伴有躯体形式的症状，一般要用去甲肾上腺素再摄取抑制剂，最常用的药物叫文拉法辛，可以改善植物神经紊乱躯体的症状，包括心脏的症状、消化系统的症状，以及泌尿系统的症状，同时也可以改善情绪以及睡眠。