结核菌感染最常感染的部位是肺部，所以肺结核是最常见的症状，常见的症状有发热，里面主要是低热、盗汗、乏力、干咳，有的患者可以痰中带血为主要表现。患者可以出现消瘦，有的结核菌感染可能是出现在肺外的部位，比如肠结核、肝结核、骨结核，肠结核往往可以是腹泻、便秘、便血交替，而肝脏的结核或者有的结核可能只以发热或者是恶心、食欲不振等为表现。
有一部分肺结核可以高热为主要表现，比如血行播散性肺结核、结核性胸膜炎，以及干酪性肺炎，往往是以高热为临床表现的。肺结核有人也可以形成结核性的脑膜炎，结核性脑膜炎往往是以发热、头痛，甚至有的患者是以意识障碍等为临床表现的，做脑脊液的检查往往呢是可以确诊，患者往往和血行播散型肺结核共存。