睡醒时嘴巴苦需要从中医学，和西医学两方面进行辨证讨论这个问题：
1、从中医学角度来讲此时是属于湿气过重，肝与胆相表里，口苦是属于胆气上溢，因为胆汁是苦的，所以肝火过旺引起胆汁的反流会导致口苦：
2、如果从西医学的角度来讲，口苦原因是属于消化系统疾病，睡醒时口苦是因为胆汁反流性胃炎而引发的，在慢性十二指肠溃疡和慢性胃溃疡的时候，胃酸分泌过多而引起胆汁反流，从而引起胃黏膜的糜烂、萎缩，因此会出现在睡醒时口苦；
3、在一些细菌性感染和病毒性感染的初期，也会在睡醒时自觉口苦。