胃里长了间质瘤相对比较严重，胃间质瘤在临床上是一种潜在的恶性肿瘤，尽管间质瘤分为良性间质瘤与恶性间质瘤，但恶性居多。恶性程度比癌症稍低，若能早期发现、早期诊断，手术切除可以达到根治的效果。但如果发现得晚，出现周围组织浸润转移，通常无法施行手术，单用分子靶向药治疗预后较差。
此外，间质瘤不能在术前进行穿刺活检，因为间质瘤是个完整的组织，术前穿刺有可能会导致肿瘤破裂、出血，或导致肿瘤播散，引起全身转移，故要尽量避免，可通过配合CT、超声内镜等提高诊断率。