细菌性阴道炎的治疗，选用抗厌氧菌药物进行治疗，主要有甲硝唑、替硝唑、克林霉素。甲硝唑可抑制厌氧菌的生长，而不影响乳杆菌的生长，是比较理想的治疗药物，但是具体的用药以及剂量的选择，要根据医生的指导进行使用，不能自己盲目的使用药物。
细菌性阴道病的特点是带有鱼腥臭味的稀薄阴道分泌物增多为特点，可伴有轻度的外阴瘙痒或烧灼感，性交后症状会加重，分泌物呈鱼腥臭味，是厌氧菌产生的胺类物质所导致的，10%-40%的患者没有临床症状。