脚垫病的治疗首先要去掉产生脚垫，穿宽松平底鞋，不要穿高跟鞋，治疗上有一个比较简单的办法，先铺一双比较厚的鞋垫，把脚垫对应的部份剪掉，走路时脚底受力部位就空出脚垫，既能减轻症状，又能让脚垫变小。
比较快的治疗方法有冷冻、激光祛除肥厚皮损。做冷冻时用比较大棉棒，沾上液氮，挤压到患处让脚垫变性、坏死、脱落。
激光是利用高温让皮垫碳化脱落，外用阿达帕林或其他维A酸类药物，逐渐调节肥厚角质增生，让脚垫变薄，或者用角质剥脱剂，如水杨酸，溶解、祛除肥厚的角质增生，让脚垫变薄。
口服维A酸类药物，如维胺酯、阿维A，也可让肥厚的脚垫变薄。