肾盂位于肾脏内侧缘的中部的肾门，如果观察肾脏的冠状切面，肾实质分为表层的肾皮质和深层的肾髓质，肾盂属于肾髓质的部分，肾髓质占肾实质的2/3，由外向内有15-20个肾锥体，然后2-3个肾椎体的尖端合成肾乳头，突入肾小盏，大约有7-8个肾小盏。其中2-3个肾小盏合成一个肾大盏，再由2-3个肾大盏汇合形成肾盂。肾脏产生的终尿经肾乳头孔流入肾小盏，再进入肾大盏和肾盂，肾盂与输尿管连接，而尿液经过输尿管进入膀胱，当发生排尿反射时膀胱的尿液会排出体外。