艾滋病贫血可以发生在艾滋病的无症状期，也可以发生在艾滋病期，约有25%的无症状艾滋病感染者，都会发生铁再利用障碍性贫血，在艾滋病期基本上所有的患者都会出现贫血。
HIV感染的患者中贫血的三种机制基本上都存在，包括骨髓生成红细胞减少、外周血红细胞破坏增加或者是失血。在艾滋病的整个病程当中发生多种感染，常被认为是进行性贫血的原因，抗逆转录病毒疗法也可能引起贫血，因为艾滋病病人需要长期应用抗病毒药物，抗病毒药物的副作用，有些就会出现骨髓的抑制，如齐多夫定就可以造成贫血，所以在临床治疗当中要定期监测，如果出现因药物引起的贫血，可以调整用药。