肥厚性心肌病导致的二尖瓣关闭不全，如果是轻度的关闭不全患者是没有症状的，可以不需要特殊的治疗，只要是每年定期查心脏彩超，随访患者的症状和体征即可。
如果是二尖瓣关闭不全严重，反流量增加会出现心功能不全、心衰的症状，临床常见的表现是劳力性呼吸困难，甚至出现夜间阵发性呼吸困难，同时出现胸痛、心慌、乏力、头晕、腹胀、双下肢水肿等症状，要给予针对心衰的药物治疗。
药物治疗主要包括扩血管的药物和利尿剂，同时可以给予β受体阻滞剂来减弱心肌收缩力，临床常用的药物，扩血管的药物如硝酸酯类或者是硝普钠、β受体阻滞剂口服治疗。
肥厚心肌病到晚期的时候会出现心律失常，常见的心律失常是心房纤颤，要给予纠正房颤的对症治疗。