口舌生疮的病因及致病机制仍不明确，常见诱因包括局部创伤、精神紧张、食物药物、激素水平改变及维生素或微量元素缺乏，另外还有系统性疾病、遗传、免疫等。中医认为其病因是由心脾积热，外感热邪，或脾胃湿热，阴虚阳亢所致。

一、疾病因素

1、口腔疾病

常见的口腔溃疡、鹅口疮、细菌感染性口炎、疱疹性口腔炎等。

2、消化系疾病

口舌生疮与消化系统疾病密切相关，常见的有胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎等，研究表明30％-48％的口腔溃疡患者有消化道疾病，如腹胀、腹泻或便秘等情况。其中9%以上有消化道溃疡。

3、自身免疫性疾病

常见的是白塞氏综合征，白塞病是一种全身性免疫系统疾病，可侵害人体多个器官，包括口腔、皮肤、关节肌肉、眼睛、血管、心脏、肺和神经系统等，主要表现为反复口腔和会阴部溃疡、皮疹、下肢结节红斑、眼部虹膜炎、食道溃疡、小肠或结肠溃疡及关节肿痛等。

4、病毒感染性疾病

最常见的是手足口病和麻疹，手足口病多发生于4岁以下的小儿，为手足口病毒感染引起的传染性疾病，伴发热及手、足、臀部皮肤疱疹；麻疹是感染麻疹病毒引起的急性出疹性传染病，可见口腔两颊黏膜见麻疹黏膜斑。

二、非疾病因素

1、内分泌变化

特殊患者，如某些女性往往在月经期发生，可能与体内雌激素量下降有关。有些女性每逢经期或行经前后就会出现口舌生疮，还常常伴有口干、心烦、易怒和大便干结等令人烦恼的症状。临床研究认为，月经期出现口舌生疮主要是由于体内黄体酮水平增高而雌激素水平降低所致。

2、精神因素

有一部分患者在精神紧张、情绪波动、睡眠状况不佳的情况下发病，可能与植物神经功能紊乱有关。

3、遗传因素

如父母双方均患有复发性口舌生疮时，其子女患病的几率较高。

4、其他因素

微量元素缺乏、维生素缺乏、营养不良等，均可能导致免疫力低下，增加口舌生疮的可能性。