偏头痛是常见的神经系统疾病之一，呈单侧搏动性中重度疼痛，可导致生活质量显著下降。偏头痛，尤其是那些伴有先兆的偏头痛患者发生中风的风险会增加，这在观察性研究中有明确记录。偏头痛与中风之间的联系机制尚未完全确定，但可能涉及动脉粥样硬化加速、血管痉挛、内皮功能障碍、特定部位引起的低氧血症和反常栓塞等。反常栓塞是指静脉系统和右心房的血栓通过心脏内的交通从右心系统进入左心系统，引起缺血性脑卒中和心、肾以及外周系统栓塞。右向左分流最常见的病因是卵圆孔未闭。偏头痛患者的卵圆孔未闭频率明显较高，尤其是伴有先兆的偏头痛患者。研究发现这两个相对普遍的临床实体之间存在因果关系。第一个支持性的证据是卵圆孔未闭封堵术可以减少偏头痛的发作。另外，有研究发现血管活性物质（如血清素）通过卵圆孔从肺循环中逸出而积聚在脑血管中，而血管活性物质通常在肺循环中代谢。这些血管活性物质，可能损害脑血管运动反应性和自我调节能力。降低脑血管运动反应性减慢了微栓子的清除，脑血管运动反应性损害可能是某些触发因素的中介机制，这个机制填补了偏头痛病理生理学的一些空白。有研究证明，高等级右向左分流的存在与偏头痛患者血管舒张性降低有关。如果偏头痛患者的卵圆孔未闭值较大，那么通过传递函数分析指标量化的脑压自动调节功能受损程度更大。