自身免疫性肝炎主要是由于自身抗体产生造成的肝细胞水肿、坏死、肝小叶破坏，所以实验室表现为转氨酶升高，谷丙转氨酶、谷草转氨酶升高，胆红素表现为总胆红素、直接胆红素、间接胆红素升高，一个肝细胞性黄疸。如果自身免疫性肝炎侵犯胆管上皮细胞，还会表现为碱性磷酸酶和γ-GT升高。自身免疫性肝炎和其它肝炎临床表现相近，主要是乏力、低热、右上腹胀痛、不适、厌油、恶心、呕吐、尿黄表现，如果不及时治疗，病人就会转成慢性，症状会长期持续2个月、3个月，甚至4-5年时间，一直进展到肝硬化、肝功能衰竭，出现肝功能衰竭表现，对雌激素灭活也会发生异常，表现为上腔静脉区域，比如前胸、手掌出现蜘蛛痣。
